在服务器系统中本来也没什么特殊设置，但是如果要装1.1和2.0的混合环境的话那么就要注意了。同时安装1.1和2.0的.net框架将会产生冲突。一般导致某个站点在10-15分钟内无法访问。原因，服务关闭。出现这种错误是因为在服务器系统中存在应用程序连接池，它的作用是提供给你设置垃圾回收的处理方案。但是1.1和2.0如果同时使用一个应用程序连接池，那么就会产生冲突。

把1.1和2.0分别放在不同的应用程序连接池中，建立站点或者虚拟目录的时候把主目录选项卡中，应用程序设置/应用程序连接池选中成对应的版本的应用程序连接池，在ASP.NET选项卡中选择应用程序的版本。 已对 IIS 6.0 进行了重新设计以便利用基本 Windows内核HTTP.sys。这使其具有内置的响应和请求缓存和队列功能，并能够将应用程序进程请求直接路由到工作进程，从而改善可靠性和性能。 IIS 6.0 引入了两种用于配置应用程序环境的操作模式:工作进程隔离模式和 IIS 5.0 隔离模式。在安装 IIS6.0时默认的隔离模式取决于您执行的是全新安装还是升级。 在全新安装 IIS 6.0 之后，IIS 以工作进程隔离模式运行。

[由IIS 5.0隔离模式切换到工作进程隔离模式， 右键点击站点-->属性-->服务选项卡-->不勾选iis 5.0隔离模式] 即可 IIS 6.0 在工作进程隔离模式下运行时，可将 Web 应用程序组合到应用程序池中。应用程序池允许将特定配置设置应用于多个应用程序组，并允许工作进程为这些应用程序提供服务。可向应用程序池指定任何 Web 目录或虚拟目录。

通过创建新应用程序池并向它们指定网站和 Web 应用程序，可提高服务器的效率和可靠性，并使其他应用程序即使在新应用程序池终止时也总是可用。 要点 您必须是本地计算机上 Administrators 组的成员或者必须被委派了相应的权限，才能执行下列步骤。作为安全性的最佳操作，请使用不属于 Administrators 组的帐户登录计算机，然后使用运行方式命令以管理员身份运行 IIS 管理器。在命令提示符下，键入 runas /user:administrative_accountname "mmc %systemroot%\system32\inetsrv\iis.msc"。

在 IIS 管理器中，展开本地计算机，右键单击“应用程序池”，指向“新建”，然后单击“应用程序池”。
在“应用程序池 ID”框中，键入新应用程序池的名称。 在“应用程序池设置”下，单击“对新的应用程序池使用默认设置”或“将现有应用程序池作为模板”。 如果您选择的是“将现有应用程序池作为模板”，请从“应用程序池名称”列表框中，单击要用作模板的应用程序池。 单击“确定”。 如何创建和隔离应用程序 要创建应用程序，应将目录指定为应用程序的开始位置（应用程序根目录）。然后您可以设置应用程序的属性。每个应用程序都可以有一个好记的名称；该名称出现在 IIS 管理器中并给出了一种区分应用程序的方法。应用程序名称不在其他地方使用。 网站默认作为根目录级别的应用程序。当您创建一个网站时，同时会创建一个默认应用程序。您可以使用这个根目录级别的应用程序，也可删除它，还可通过删除它并创建一个新应用程序来替换它。 要点 您必须是本地计算机上 Administrators 组的成员或者必须被委派了相应的权限，才能执行下列步骤。作为安全性的最佳操作，请使用不属于 Administrators 组的帐户登录计算机，然后使用运行方式命令以管理员身份运行 IIS 管理器。在命令提示符下，键入 runas /user:administrative_accountname "mmc %systemroot%\system32\inetsrv\iis.msc"。

程序 在 IIS 管理器中，展开本地计算机，右键单击作为应用程序开始位置的目录，然后单击“属性”。 单击“主目录”、“虚拟目录”或“目录”选项卡。 在“应用程序设置”部分，单击“创建”。如果看到的是“删除”按钮（而非“创建”按钮），则说明应用程序已经创建。 在“应用程序名”框中，键入应用程序的名称。 单击“确定”。 隔离应用程序表示将它们配置为在与 Web 服务器和其他应用程序不同的进程（内存空间）中运行。可在下列某种隔离模式下运行 IIS 6.0：工作进程隔离模式或 IIS 5.0 隔离模式。IIS 不能同时在这两种模式下运行。 在全新安装时，工作进程隔离模式是运行服务器的默认模式。在该模式中，可通过将应用程序添加到包括隔离设置的应用程序池中来隔离它。有关创建和配置应用程序池的详细信息，请参阅配置应用程序池。

在 IIS 管理器中，展开本地计算机，展开“网站”文件夹，右键单击要隔离的应用程序，然后单击“属性”。 单击“主目录”、“虚拟目录”或“目录”选项卡（取决于应用程序）。 在“应用程序设置”部分中，在“应用程序池”列表框中，单击应用程序池。 单击“应用”，然后单击“确定”。 IIS 5.0 隔离模式允许您在 IIS 6.0 中运行为早期版本的 IIS 开发的应用程序。 在 IIS 5.0 隔离模式中隔离应用程序 在 IIS 管理器中，展开本地计算机，展开“网站”文件夹，右键单击要隔离的应用程序，然后单击“属性”。 单击“主目录”、“虚拟目录”或“目录”选项卡（取决于应用程序）。如果在列为“开始位置”目录的目录中，则“应用程序名”框已填好。 从“执行权限”列表框中，单击相应的进程选项。 单击“确定”。在创建单独的进程之前，Web 服务器将完成任何当前的对应用程序请求的处理。在对应用程序的下一个请求中，应用程序将在相应的内存空间中运行。 注意 服务器端的包括文件 (SSI) 和 Internet 数据库连接器 (IDC) 应用程序无法在 Web 服务器之外的内存空间运行。 要点 只有在工作进程隔离模式下运行时才能使用这个 IIS 6.0 功能。